Permanent : Franck Plouraboué
Collaborateurs : Caroline Fonta Centre de Recherche Cerveau & Cognition Toulouse (CERCO UMR 55499), Xavier Descombes and Grégoire Malandain, Morphème team INRIA Sophia Antipolis,Laurent Risser Institut de mathématique de Toulouse IMT UMR 5219), Louis Casteilla, Corinne Barreau, Anne Lorsignol (StromaLab, UMR 5273)
Cette activité s’intéresse à la structure et aux échanges dans les tissus. On développe des méthodes pour :
- quantifier l’organisation des modules vasculaires
- Comprendre les couplages entre modules arteriels et veineux
- Analyser /classifier les territoires normaux ou pathologiques.
On utilise et adapte différentes méthodes d’analyse d’image (segmentation, watershed, carte des distances, morphologie mathematique), de graphes (modularisation, graph-cutt, recouvrement maximum), et de modélisation d’écoulements micro-vasculaires.
Publications
- R. Guibert, F. Plouraboué and C. Fonta, Cerebral blood ow modeling in primate cortex, J. Cereb. Blood flow and Metabolism, 30, 11, 1860-1873, 2010.
- R. Guibert, C. Fonta, L. Risser, & F. Plouraboué, Coupling and robustness of vascular units in cortex, Neuroimage , 62, 1, 408-417, 2012.
- X. Descombes, F. Plouraboué, A. El Boustani, C. Fonta, G. LeDuc , R. Serduc, T. Weitkamp, Brain tumor vascular network segmentation from micro-tomography, IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, ISBI Conference paper 1026, Chicago USA, 2011.
- F. Plouraboué, L. Risser, X. Descombes, P. Cloetens, T. Weitkamp, G. Le Duc, C. Fonta, C, Analysis by RX micro-tomography in normal and tumoral vascular networks in the brain, Bulletin du cancer, 98 Supplement : S Pages : S57-S57 , 2011.
- X. Descombes, F. Plouraboué, A. El Boustani, C. Fonta, G. LeDuc , R. Serduc, T. Weitkamp, vascular network segmentation : an unsupervised approach, IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, ISBI Conference paper 1198, Barcelona, Spain, 2012.
- T Xiong, H Ilmi, Y Hoarau, P Choquet, C Goetz, A Fouras, S Dubsky, M Braza, S Sainlos-Brillac, F Plouraboué, D Lo Jacono, Flow and particles deposition in anatomically realistic airways, Computer Methods in Biomechanics and Biomedical Engineering, 15, 1, 56-58, 2012.
- R. Guibert, C. Fonta, F. Estève & F. Plouraboué, On the normalisation of cerebral blood flow, J. Cereb. Blood flow and Metabolism, 33, 669-672, 2013.
- C Barreau, C Guissard, E Labit, J Rouquette, ML Boizeau, Souleymane, A Carrière, Y Jeanson, F Plouraboué, L Casteilla and A Lorsignol, Regionalization of browning revealed by whole inguinal adipose tissue imaging, 24, 5, 1081-1089, Obesity, 2016.
- P. Kennel, C. Fonta, R. Guibert & F. Plouraboué, Analysis of vascular homogeneity and anisotropy, Human Brain Mapping, 38, 11, 5756-5777, 2017.
